吉林市农业科学院植物保护研究所主要围绕吉林地区主要农作物病、虫、草、鼠害的鉴定、发生规律的调查研究及综合防治技术的研究。

植物保护研究所现有科技人员10人，其中正高级职称2人、副高级职称4人、中级职称3人，初级职称1人。曾先后完成了省、市科研课题20余项，获得吉林省科技进步奖4项、吉林市科技进步奖8项、吉林市农业技术推广奖3项、吉林市自然科学学术成果奖4项。在省级以上期刊发表学术论文20余篇。九十年代自主研发了除草剂、杀菌剂等10余项科研成果。其中，复配农药除草剂40%杀草特乳油的研制成功，达到当时国内同类产品的先进水平，填补了吉林省无复配除草剂的空白，累计推广面积达500多万亩，创造了显著的经济及社会效益.