吉林市农业科学院薯类作物研究所主要围绕马铃薯、甘薯等薯类作物以及花生种质资源收集、创新、利用，新品种选育和栽培技术研究，提升区域薯类研究科技创新能力；依托吉林省中东部山区半山区湿润冷凉气候条件，为薯类育种、种薯繁育（种源）基地建设提供技术保障；为地区薯类生产提供服务，为吉林地区薯类产业发展提供技术支撑和品种支持。 

薯类作物研究所收集鉴定马铃薯种质资源200余份，甘薯资源50余份、花生资源100余份。筛选出适宜吉林地区种植的马铃薯品种资源4个，甘薯资源1个，花生资源3个，创制改良部分资源，筛选出马铃薯优良骨干系亲本4个，马铃薯九薯1号、花生九花生1号新品系正在开展登记。建立了薯类组培室，开展脱毒研究，建设网棚、杂交棚。承担省科技发展计划项目“马铃薯优质多抗种质资源创制与新品种选育”、吉林市科技创新发展计划杰出青年项目“马铃薯种质资源创制及人工授粉技术研究”，以及吉林市农业技术推广奖项目1项，为进一步开展薯类科研工作和为地区薯类产业发展服务奠定了基础。