吉林市农产品质量监督检验中心是2011年3月依据吉市编办字【2011】63号文批准成立的，是进行农产品质量安全的检验检测机构。中心加挂于吉林市农业科学院。

2018年初，吉林市农产品质量监督检验中心顺利地通过省级“双认证”，取得了CMA和CATL证书。中心现已正式开展农产品检验检测工作。

吉林市农产品质量监督检验中心，建筑面积为1769平方米。面对吉林地区的农产品、农业投入品、产地环境等三大领域质量安全方面进行法定检测工作。检测范围涵盖种植业、养殖业、农业投入品。检测内容包括营养成分、药物残留、重金属元素、病原微生物、生物毒素、转基因成分和其他污染物授权检测参数。年检测样本能力5216个，基本实现对我市的农产品及初级加工农产品检测的全覆盖。中心现有检测仪器设备比较齐全和先进，已达到国内同行业一流水平，现拥有各类检测设备216台套，其中进口大型分析仪器15台/套。中心配备了与其承担检测任务相适应的管理人员和技术人员。现有职工16名，其中高级技术职称2人,中级技术职称10人，完全能够满足检测工作所需。吉林市农产品质量监督检验中心通过资质认定和机构考核，结束了我市长久以来没有专职从事农产品质量安全检测机构的历史。同时，也势必会对我市农产品安全监管及吉林地区农业发展和为“三农”工作服务提供强有力的技术支持。